凌恩数据库和服务器平台构建服务

凌恩生物

- BIOZERON -

数据库系统构建服务

立足后组学时代助力生物医学大数据

产出速度快

课题组已积累基因组、转录组、SNP、蛋白代谢等已发表多组学数据资源。项目启动后，半年内完成数据整合和数据库构建，同时同步完成文章写作工作

提升文章档次

课题组正在进行基因组、泛基因组相关的研究。建议同时开展配套的数据库构建工作，提前锁定影响。一方面丰富基因组、泛基因组研究的内容和成果展示形式，提升文章档次。另一方面，数据库后续可作为独立成果发表，形成连续性工作

长期获益

数据库平台的建设和构建方便了相关的科研人员利用和挖掘相关数据资源，加速研究进展。同时为项目和成果申报打下坚定的平台基础

个性化定制生信分析服务器

十年生信经验总结生物信息分析最佳选择

JH1系列高端机架式服务器

适用于服务器机房

性能强劲，内存高，存储大

128核心256线程，1T内存，284TB存储

JH2系列高端机架式服务器

适用于服务器机房

性能强劲，内存高，存储大

96核心192线程，512G内存，192TB存储

TH1系列高端塔式服务器

可放置于办公室

性能优异，体积小，静音

128核心256线程，1T内存，128TB存储

TH2系列高端塔式服务器

可放置于办公室

性能优异，体积小，静音

96核心192线程，512G内存，128TB存储

构建案例

数据库开发案例

动植物多组学数据库

环境生态数据库

特色数据库

医学方向数据库

特色数据分析平台

MODMS：紫花苜蓿多组学数据库

MODMS是一个综合性的首蓿多组学数据库，包含首蓿多个参考基因组，涵盖基因基本信息、功能信息、比较基因组信息。同时还囊括重测序、转录组、蛋白组、代谢组等多组学数据。该数据库是一个用户友好的多组学数据库，为首蓿生物学研究提供了全面的数据资源和分析工具

文章成果标题：MODMS: a multi-omics database for facilitating biological studies on alfalfa ( Medicago sativa L.).

文章成果链接：https://academic.oup.com/hr/article/11/1/uhad245/7452859

发表杂志/IF：Horticulture Research（IF：7.6）

合作单位：兰州大学交付时间：2024年

数据库平台链接：https://modms.lzu.edu.cn/

中国淡水大型底栖无脊椎动物条形码数据库

亮点1：COI条形码和线粒体基因组信息明显增加

数据库已上传条形码物种：2645种，条形码数量：4785条，线粒体基因组：341个,整合了同一物种的分类、分子条形码、地理分布以及不同虫态形态图像等信息

亮点2：一站式分子鉴定及分析功能

数据库具备BLAST比对功能，能够得到按相似度排列的分子鉴定结果。同时配备了Muscle、GeneWise、LASTZ、Compare等生信分析工具

亮点3：高效且操作简便的环境DNA-宏条形码数据在线分析模块

数据库开发了一个简便易懂的宏条形码数据自动分析模块，在原有OTU聚类分析模块的基础上，增加了ASV分析模块,方便了宏条形码数据的处理分析

合作单位：南京农业大学交付时间：2025年

数据库平台链接：http://cfmlib.njau.edu.cn/

CUCUME：葫芦科物种RNA甲基化数据库

CUCUME构建了一个整合葫芦科不同组织系统mRNA信号、GWAS和QTL遗传调控和表观遗传学的RNA甲基化数据库。数据库的建立将有助于进一步了解葫芦科RNA甲基化在RNA系统性运输和QTL中的作用，最终有利于未来农用作物种质资源的选育

文章成果标题：CUCUME: An RNA methylation database integrating systemic mRNAs signals, GWAS and QTL genetic regulation and epigenetics in different tissues of Cucurbitaceae.

文章成果链接：https://www.csbj.org/article/S2001-0370(23)00010-7/fulltext

发表杂志/IF：Computational and Structural Biotechnology Journal（IF：6）

合作单位：中国农业大学设施蔬菜作物生长发育调控北京市重点实验室交付时间：2023年

数据库平台链接：http://cucume.cn/

FLIBase：人类癌症和组织全长转录本数据库

FLIBase数据库收集了来自正常人和癌症患者细胞组织的351个全长转录组和12469个二代转录组测序数据，共包含983789个全长转录本可变剪切体信息。同时，FLIBase 数据库提供了准确且全面的全长转录本注释，这些肿瘤特异性RNA转录本有可能成为免疫原性复发性新抗原的来源，可以推动和辅助开发针对各种类型人类癌症的定制RNA诊断和治疗策略

文章成果标题：FLIBase: a comprehensive repository of full-length isoforms across human cancers and tissues

文章成果链接：https://academic.oup.com/nar/article/52/D1/D124/7269180

发表杂志/IF：Nucleic Acids Research （IF=16.7）

合作单位：复旦大学交付时间：2023年

数据库平台链接：http://www.FLIBase.org